โครงสร้างของเครื่องปฏิกรณ์ IC มีลักษณะเป็นอัตราส่วนความสูงขนาดใหญ่ โดยทั่วไปสูงถึง 4 -, 8 และความสูงของเครื่องปฏิกรณ์ถึง 20 ซ้าย ม. ขวาเครื่องปฏิกรณ์ทั้งหมดประกอบด้วยห้องปฏิกิริยาแอนแอโรบิกห้องแรกและห้องปฏิกิริยาแอนแอโรบิกห้องที่สองเครื่องแยกก๊าซ ของแข็ง และของเหลวแบบสามเฟสถูกติดตั้งไว้ที่ด้านบนสุดของห้องทำปฏิกิริยาแบบไม่ใช้ออกซิเจนแต่ละห้องเครื่องแยกสามเฟสระยะแรกส่วนใหญ่แยกก๊าซชีวภาพและน้ำ ตัวแยกสามเฟสที่สองส่วนใหญ่แยกกากตะกอนและน้ำ และกากตะกอนที่ไหลย้อนและไหลย้อนจะถูกผสมในห้องปฏิกิริยาแบบไม่ใช้ออกซิเจนห้องแรกห้องปฏิกิริยาแรกมีความสามารถที่ดีในการกำจัดสารอินทรีย์น้ำเสียที่เข้าสู่ห้องปฏิกิริยาแบบไม่ใช้ออกซิเจนที่สองสามารถบำบัดต่อไปเพื่อกำจัดสารอินทรีย์ที่เหลืออยู่ในน้ำเสียและปรับปรุงคุณภาพน้ำทิ้ง